文部科学省・厚生労働省
花粉症患者の増加に伴って、医療機関だけではなく、政府としても積極的に取り組む必要性が出てきたことから、各省庁で花粉症予防、治療のために、様々な対策がなされています。
大学等、研究機関での、花粉症の病態解明の研究を推進。
理化学研究所、免疫・アレルギー科学総合研究センターでは、免役システムの基礎的・総合的な研究を行い、花粉症等のアレルギー疾患の原因究明と治療法開発。 アレルギー疾患について臨床研究事業を推進。（厚生労働科学研究費補助金免疫アレルギー疾患予防・治療研究事業） 理化学研究所において、免疫・アレルギー科学総合研究センター発足
国立相模原病院（現独立行政法人国立病院機構相模原病院）に臨床研究センターを開設、アレルギー疾患に関する臨床研究を行う。 理化学研究所免疫・アレルギー科学総合研究センターと国立病院機構相模原病院は、基礎研究成果の臨床への応用を推進するため、アレルギーワクチン開発等の共同研究を行っている。
アレルギー疾患について臨床研究事業を推進。（厚生労働科学研究費補助金免疫アレルギー疾患予防・治療研究事業） 花粉症に対する適切な医療の確保（厚生労働省） 診療ガイドライン等の周知徹底。
医療機関向け専門相談窓口を開設する等して、適切な医療の確保に努める。
医薬品の確保を都道府県等に協力依頼。